腸道全菌群多樣性健康咨詢 Intestinal Microflora Diversity Analysis and Consulting
DGGE等分子生物學方法及生物芯片對腸道菌群進行研究存在一定的缺陷。如DGGE只能檢測到環境樣品中十幾種優勢菌，但是對痕量微生物卻束手無策。DCGE中，電泳條帶中包含不只一種16SrDNA序列，要獲悉具體的菌種信息，還需進行克隆、測序，實驗操作繁瑣；此外，采用這種方法不能反映微生物的豐度情況。而生物芯片通過固定在芯片上的探針來獲得微生物多樣性的信息，“只能驗證已知，卻無法探索未知”，通過信號強弱判斷微生物的豐度也不是非常的準確。新一代高通量測序技術以其數字化信號、高數據通量、高測序深度、高準確率等特點，已被廣泛的應用于腸道菌群的研究中。高通量測序法分析菌群可以分析包括痕量微生物在內的大多數菌種，也能發現菌群中未知菌種，數據準確全面可靠。
■分析項目：
●腸道細菌菌群多樣性(香農曲線)；
●腸道細菌Top20菌屬分析(可以擴展到前50種)；
●腸道細菌各主要菌群的含量排序；
●主要有益和有害菌的分析、綜合健康建議;
■分析樣品
10克新鮮或妥善保存的糞便；
■采樣注意事項：
需要按指導說明操作；
■報告周期：15-20天
腸道菌群多樣性：
用來分析腸道菌屬種類是否多樣的統計學方法，式整體上對菌群情況的分析。橫坐標代表測序讀數OTU的序數，縱坐標代表該測序OTU的豐度值；每條折線代表某一物種的測序讀數OTU豐度分布，每種物種的豐富程度由曲線在橫軸上的長度來反映，曲線跨度越大表示物種的組成越豐富；物種組成的均勻程度由曲線的形狀來反映，曲線越平坦，表示總體物種組成的均勻度越高。
16srDNA測序：
16SrDNA分析，是指用利用細菌16SrDNA序列測序的方法對細菌進行種屬分析。包括細菌基因組DNA提取、16SrDNA特異引物PCR擴增、擴增產物純化、DNA測序、序列比對等步驟。是一種快速獲得細菌種屬信息的方法。
常見的益生菌和有害種屬：
幾種常見有益菌和常見有害菌按照菌的屬（細菌分類有門、綱、目、科、屬、種等級）。乳桿菌屬 Lactobacillus、雙歧桿菌屬 Bifidobacterium、大腸埃希氏菌Escherichia、檸檬酸桿菌屬Citrobacter為常見無害的菌群種類；其中乳桿菌和雙歧桿菌為常見的益生菌。韋氏梭菌(Clostridium Wellchii)、葡萄球菌Staphylococcus、變形桿菌proteus species、假單胞菌Pseudomonada- ceae、韋榮氏球菌屬 Verllonella、肺炎克雷伯菌 klebsiella pneumoniae為常見可能出現有害菌的菌屬。志賀氏菌屬 Shigella Castellani、 沙門菌屬Salmonella 為著名有害菌屬。
分析后干預：
1）補充必要的商業化益生菌：缺少雙歧桿菌屬的補充雙歧桿菌屬，缺少乳桿菌的可以合理補充嗜酸乳桿菌等乳桿菌、植物乳桿菌類益生菌。
2）腸道菌群alpha多樣性下降的人群合理多樣化飲食；
3）腸道菌群alpha多樣性下降的人群合理其他腸道營養如谷氨酰胺、N-乙酰氨基葡萄糖、腸道消炎補充劑、短鏈脂肪酸等腸道營養加快健康腸穩態的形成；
4）如發現潛在或重要有害菌，作為醫生治療腸道疾病的重要參考；
此分析可提供的重要信息如下：
●腸道細菌菌群多樣性；
●腸道細菌Top20菌屬分析；
●腸道細菌各主要菌群的含量排序；
●主要有益和有害菌的分析；
●分析后健康建議；
檢測報告報告范例：
說明：幾種常見有益菌和常見有害菌按照菌的屬（細菌分類有門、綱、目、科、屬、種等級）。乳桿菌屬 Lactoba- cillus、雙歧桿菌屬 Bifidobacterium、大腸埃希氏菌Escherichia、檸檬酸桿菌屬Citrobacter為常見無害的菌群種類； 其中乳桿菌和雙歧桿菌為常見的益生菌。韋氏梭菌(Clostridium Wellchii)、葡萄球菌Staphylococcus、變形桿菌proteus species、假單胞菌Pseudomonadaceae、韋榮氏球菌屬 Verllonella、肺炎克雷伯菌 klebsiella pneumoni- ae為常見可能出現有害菌的菌屬。志賀氏菌屬 Shigella Castellani、 沙門菌屬 Salmonella 為著名有害菌屬。
主要20種菌簡要分析（此分析將根據個人差異進行智能化個性分析）
檢測指標與簡明分析：
1.雙歧桿菌Bifidobacterium,常見的一種益生菌,具有抗腫瘤、增強免疫、改善胃腸道、抗衰老作用，占42.86%;
2.擬桿菌屬Bacteroides，化能有機營養的專性厭氧桿菌，占14.81%;
3.瘤胃菌屬 Ruminococcaceae_UCG-014, 凝固型苦蕎酸奶降低此菌豐度；合生元治療慢性功能性便秘后此菌豐度上升，黃芩湯對潰瘍性結腸炎大鼠治療后，此菌豐度增加，占9.86%;
4.普氏糞桿菌Faecalibacterium，可以產生丁酸，一般具有抗炎作用，占6.73%;
5.扭鏈瘤胃球菌 Lachnospira,為一種潛在的有益菌, 可發酵葡萄糖的產物包括甲酸、乳酸、乙酸、乙醇、CO2和H2。發酵果膠的產物與葡萄糖的相同并產甲醇。幼兒若此菌豐度過低，在3歲時更容易被診斷患有哮喘，占3.13%;
6.[Eubacterium]_rectale_group菌，目前研究較少，功能未知，占2.29%
7.另枝菌屬 Alistipes,與氧化三甲胺TMAO有關，也與腸易激綜合癥相關，占1.77%;
8.巴恩斯氏菌Barnesiella，可促進環磷酰胺誘導的治療性免疫調節效果，占1.6%;
9.瘤胃球菌科Ruminococcus_2，合生元治療慢性功能性便秘后此菌豐度降低，占1.59%;
10.副桿菌屬Parabacteroides，生酮飲食提高Parabacteroides菌的豐度，科學家們懷疑這種細菌是提供抗癲癇保護的關鍵；此菌與腸易激綜合癥負相關，占1.58%;
11.真桿菌屬成員[Eubacterium]_coprostanoligenes_group，一種產糞甾醇真細菌，它能將膽固醇分解為不能被吸收的糞甾醇,隨著糞便排出體外，糞甾醇的比例能達到50%。這就意味著，腸道內有此產糞甾醇真細菌的人吃下高膽固醇食物后吸收的部分比其他人要少一半，占1.4%;
12.瘤胃菌科Ruminococcus_1，此菌在相對豐度顯著在腎結石患者中顯著降低，占1.21%;
13.罕見小球菌屬 Subdoligranulum,來自人類排泄物中的新屬，該菌體能利用許多糖類物質（即N-乙酰-D-葡萄糖胺，N-乙酰-D-甘露糖胺等可腸道內發酵產生短鏈脂肪酸，是益生菌，占0.93%;
14.凸腹真桿菌[Eubacterium]_ventriosum_group，孕期增重過量人群此菌減少，占0.91%;
15.考拉桿菌屬 Phascolarctobacterium,通常是一種有益的菌，此菌豐度高的人容易減肥，占0.81%;
16.柯林斯氏菌 Collinsella,與脂質代謝異常、II型糖尿病正相關，占0.72%;
17.薩特氏菌屬Sutterella，超過一半的伴有胃腸功能障礙的自閉癥兒童腸道中發現此菌，此外此菌在腹瀉動物模型中顯著上升，占0.59%;
18.鏈型桿菌屬Catenibacterium，慢性功能性便秘患者中此菌減少。高心血管風險的患者腸道缺少此菌；此菌在終末期腎病患者中顯著減少；多囊卵巢綜合征患者腸道中此菌和Kandleria菌屬豐度增加；長期在島嶼上的老年婦女體內容易富集此菌；黎族人腸道容易富集此菌，占0.57%；
19.真桿菌屬成員[Eubacterium]_ruminantium_group，反芻動物真桿菌，對機體有營養、生物拮抗和維持腸道微生態平衡功能, 慢性功能性便秘患者腸道此菌增多，占0.48%;
20.毛螺菌科Lachnospiraceae的一種未分類菌Lachnospiraceae_unclassified, 一類通常在人類腸道和其他的哺乳動物腸道中發現的細菌，占0.42%;
3.3菌群個性化綜合分析:
本次總讀數為68562，達到測序極限，分析樣品排名前20的菌屬見18頁。
將菌群多樣性分為“差，一般，良好，好，非常好”，則該個體腸道菌群整體菌屬的種類一般，多樣性一般；
就熟知的有益菌而言，如雙歧桿菌屬等含量非常高，與長期補充單一富含此菌的益生菌有關，但其他常見的益生菌屬如考拉桿菌、乳桿菌等也缺少。雙歧桿菌是一種生理性有益菌，對人體健康具有生物屏障、營養作用、抗腫瘤作用、免疫增強作用、改善胃腸道功能、抗衰老等多種重要的生理功能。調整腸道菌群平衡，抑制腸道不良微生物的增殖。嗜酸乳桿菌對致病微生物具有拮抗作用。嗜酸乳桿菌能分泌抗生物素類物質(嗜酸乳菌素(acidolin)、嗜酸桿菌素(acidophilin)、乳酸菌素(laetocidon), 對腸道致病菌產生的拮抗作用。
此雖然個體也含有一些其他常見的有益的菌屬，如普氏糞桿菌Faecalibacterium，總體而言，各類有益菌屬種類多樣性不夠。建議還可以補充嗜酸乳桿菌等乳桿菌、植物乳桿菌等多種已有的商品化益生菌; 同時，合理選擇富含膳食纖維的食物和合理使用各種益生元，盡快促進健康腸穩態的建立。
測序分析表明該個體含有的常見潛在有害菌屬較少。測序結果還提示，該個體與II型糖尿病風險相關菌屬很多；與肥胖、腸易激綜合癥、中風，慢性腎病，便秘風險相關的菌屬也較多，建議用戶加強此類病的預防和健康管理。綜合以上分析，建議個體采取有力措施，維持腸道菌群的多樣性。
